Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRE11P49959 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRE11P49959 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 737.5 ms