Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF6P49848 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF6P49848 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms