Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms