Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms