Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MDH1P40925 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MDH1P40925 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms