Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms