Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA3P29320 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms