Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E1P29083 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms