Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms