Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms