Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms