Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMA3P25788 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA3P25788 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms