Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT1P21579 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms