Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF3P18847 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF3P18847 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF3P18847 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF3P18847 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATF3P18847 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms