Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VCLP18206 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VCLP18206 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VCLP18206 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms