Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-EP13747 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms