Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms