Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH1P12830 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms