Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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