Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms