Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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