Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms