Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms