Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms