Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSVO60911 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSVO60911 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms