Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms