Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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