Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLOCKO15516 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLOCKO15516 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLOCKO15516 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms