Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F3O00716 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms