Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms