Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms