Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms