Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms