Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms