Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms