Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms