Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH3Q9UHC1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms