Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DKK2Q9UBU2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms