Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms