Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms