Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms