Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms