Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP35Q9NRY4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP35Q9NRY4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms