Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms