Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms