Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms