Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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