Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC2Q9C0B9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms