Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009088.1-201ENST00000565152 833 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007346.1-202ENST00000602826 684 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.79-201ENST00000610676 290 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022486.1-201ENST00000510613 1483 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms