Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms